有鉴于此，努尔哈赤痛心疾首，决心整编军事力量，从1592年前后，努尔哈赤参照金朝时女真人的猛安谋克制度，对牛录组织首次进行大规模改造与重建，规定300人为一牛录，5牛录为一甲喇，5甲喇为一固山，分别以牛录额真、甲喇额真、固山额真为首领，改编后的牛录被分别隶属于黄、白、红、蓝四旗，以纯色为辨，进而创建了八旗制度，平时为民，战时为兵。
其二，有了能战斗的军队，还得有严格的军队纪律，努尔哈赤的军队分作前锋 、 马队等 ， 各司其责 ， 临战状态下谁不尽责就立地处死 。 如前锋 ， 都披重铠冒敌人枪林弹雨 ， 身后才是善射的弓箭手 ， 不管敌人的攻击多么猛烈 ， 没有指令前锋不能退 后一步 ， 否则统领前锋的人就斩杀敢停步不前的人 。这样的军规下，将士唯有勇往向前，因为后退即死。他最亲信的大臣额尔都在沈阳城外的一次战斗中，没有很好地配合贝勒莽古尔泰追击明军，被定为死罪，努尔哈赤虽念其屡建大功，免其死罪，但还是削籍产，予以重罚。
对于勇敢的人，则大肆奖赏，毫不吝啬。1625年，毛文龙带兵偷袭后金官屯城时，被后金的三位妇女发现，她们摇旗呐喊，上城砍杀爬墙之兵，战后被努尔哈赤接见，奖励黄金百两。大大调动了军队的积极性，有点类似于秦朝的军功制度，想要荣华富贵，就要有军功。
其三，引进先进武器和技术。努尔哈赤在与明军的交战过程中，深知火器的厉害，通过俘虏的明朝工匠，积极改进自己的火炮武器等，并从外进口新式大炮，以提高军队的战斗力。这些武器和技术的引进，使得后金军队在装备上慢慢占据了优势，战斗力得到了显著提升。
其四，努尔哈赤非常重视情报的收集和分析，他认为只有了解敌人的动态和意图，才能制定出有效的作战策略。萨尔浒大战前，努尔哈赤就通过细作，提前知道了明军的作战意图，制定了，凭尔几路来，我只一路去，的作战方针，打赢了这场关乎国运的战役。
努尔哈赤通过这一系列的措施，极大增强了后金军队的战斗实力，打造了一支能战敢战的劲旅，最终成为了明王朝的掘墓人。
