收购雅虎中国曾是马云最后悔的决定，这一次兼并一度差点把阿里巴巴逼到死路，不过在与Yahoo为代表的国际资本交锋中，马云和他的团队展现了极强的专业性，也展现了中国企业家自信自强的一面，绝不轻易向无理的国际资本妥协。 起初还是好的，Yahoo以“10亿美金+雅虎中国”换取阿里巴巴40%的股权，软银为首的阿里早期投资者成功套现，Yahoo持股40%为阿里第一大股东，马云团队持股比例为31%，软银股份稀释至29%，淘宝、支付宝、雅虎中国成为阿里集团的全资子公司，这为阿里巴巴带来了充足的资金，也避免了软银将股份卖给eBay导致经营性风险，不过这也为阿里的管理埋下了危机，就是马云为首的国内团队很可能丧失控制权。尽管为了对抗这种风险，马云在交易中加了三个条款，Yahoo40%的股权只有35%的投票权，多余的5%投票权归马云团队，这样马云团队就以1%的微弱优势领先Yahoo，同时Yahoo和软银都只有一个董事会席位，马云团队两个，当然还有一条是，这个协议至少要持续到2010年10月，并且这期间董事会不能解除马云阿里巴巴CEO职务，也就是说在长达5年的时间阿里的控制权是安全的，这样他就有足够的时间来对付eBay。 马云也确实厉害，这5年时间内，淘宝把eBay踢出中国市场，不过与此同时危机也来了，大股东Yahoo衰落了，马云最信任的人杨致远被迫从CEO的位置辞职，野蛮人铁娘子巴茨接任，巴茨战略能力一般但是搞事能力一流。先是指责马云没把雅虎中国做好，其次巴茨要通过完全掌控阿里巴巴来稳固自己Yahoo CEO的位置，并且希望以此改善Yahoo的发展颓势。尽管马云公开表示，阿里巴巴愿意回购Yahoo所持有的阿里巴巴全部股份，并且帮助其设计一套避税方案，不过发展如日中天的阿里巴巴实力早已经超过了大股东Yahoo，Yahoo怎么舍得出手自己的股份，这可是太幼优质的资产了。 剥离支付宝是无奈之举也是不得不做的事情，绝对不能让外资控制中国金融。但是Yahoo就拿支付宝剥离发起舆论战，在中外媒体上大量诋毁马云为首的管理层“偷走了Yahoo的支付宝”，对于阿里来说，这个操作不完美但是绝对且唯一正确，并且有董事会会议记录为证，马云也在第一时间告知了董事会这项决议，大股东Yahoo和软银绝对不是不知情。后来阿里用70.82亿美金的代价回购了Yahoo手中一半的股权，最后在IPO之前再一次将Yahoo的股权降到了13%以下，并且在阿里巴巴再次上市之前，设计了合伙人制度，阿里终于永远地解决了经营性风险问题。
