噶尔丹兵败后，仅剩下女儿钟济海、两位军官和不足百人的卫队还在身边。这个曾经坐拥十万大军、不可一世的枭雄，在走投无路之下五脏俱焚而亡。
主要信源：（澎湃新闻——昭莫多之战：准噶尔蒙古人与大清帝国的二度对决；《中国历史辞典》——第三册；《卫拉特蒙古史纲》；《卫拉特蒙古史纲》）
公元1688年，准噶尔部首领噶尔丹率军大举进攻漠北蒙古，短时间内连续击败多个部落，几乎控制了整个喀尔喀地区。
可是正当他在草原上势头迅猛之际，远在新疆的根据地却发生了叛乱。
南部地区民众起兵反抗准噶尔统治，虽然这场叛乱很快被噶尔丹的侄子策妄阿拉布坦平定，但此事却成为噶尔丹人生走向下坡的转折点。
噶尔丹与侄子的矛盾早已存在。
他的哥哥僧格早在1670年因贵族内斗被杀，当时僧格的几个儿子都还年幼，噶尔丹因此得以接管权力。
但随着孩子们逐渐长大，尤其是索诺布阿拉布坦和策妄阿拉布坦展现出才能，继承问题逐渐浮现。
按照传统，索诺布阿拉布坦才是合法继承人，但噶尔丹始终不愿交还权力。
1688年冬，噶尔丹听信身边人挑拨，担心侄子势力坐大，竟派人暗杀僧格的儿子。
索诺布阿拉布坦被毒杀，而策妄阿拉布坦则侥幸逃脱，带领七位老臣和五千户牧民迁往别处。
这批牧民中以杜尔伯特人为主，他们不仅放牧，也从事农耕，原本是噶尔丹军队粮草的重要供应力量。
他们的离开，直接导致前线物资供应紧张。
噶尔丹得知策妄阿拉布坦逃走，亲率两千多人追击，却在乌兰乌苏被击败。
策妄阿拉布坦退到博尔塔拉河一带的冬季牧场，在那里招兵买马，吸纳对噶尔丹不满的部众，并主动向清朝靠拢，派遣使者朝贡。
这一举动不仅削弱了噶尔丹的势力，更让他失去了关键的过冬基地。
噶尔丹虽多次发兵征讨，却未能彻底消灭策妄阿拉布坦，反而又一次被打败，只能暂时将对方限制在博尔塔拉区域。
面对僵局，噶尔丹决定暂时放下西北问题，继续向漠北蒙古推进，计划日后再回头解决侄子问题。
1689年，他带领三万军队越过乌尔会河，进攻喀尔喀及漠南蒙古，初期取得不少胜利。
但就在他全力东进之时，策妄阿拉布坦再次发难，趁机夺取阿尔泰山以西的大片土地，包括准噶尔的核心区域，并将噶尔丹东归之路切断。
这一招极为致命。
噶尔丹失去了根据地和后勤支持，军队物资日益匮乏。
他试图通过外交手段争取沙俄支持，提出将雅克萨地区让予俄国，以换取军事援助。
但由于此前清俄《尼布楚条约》已签订，沙俄为避免与清朝直接冲突，并未公开支持噶尔丹，仅利用局势在外交上争取更多利益。
噶尔丹陷入两难。
他既不肯放弃征服蒙古的计划，又急于解决后方问题。
于是分兵回新疆平乱，自己则留在漠北继续征战。
不料派回的军队被策妄阿拉布坦打败。
与此同时，康熙皇帝调动大军，准备彻底解决噶尔丹问题。
1690年，噶尔丹与清军在乌兰布通爆发大战。
噶尔丹战败撤退，途中又遭遇粮荒和瘟疫，士兵死伤惨重，最终仅数千人逃回科布多营地。
更糟糕的是，策妄阿拉布坦趁他兵败，突袭其大本营，抢走所有牲畜、财产和人口，连噶尔丹的妻子阿奴可敦也被掳去。
之后策妄又攻取撒克里、乌兰固木等地，进一步压缩噶尔丹的生存空间。
西藏的桑杰嘉措曾试图调解，一方面援助噶尔丹，一方面要求策妄阿拉布坦归还部分物资。
借此帮助，噶尔丹稍事恢复，再度活跃于漠北。
但康熙帝于1696年又一次亲征，两军在昭莫多决战。
噶尔丹再遭惨败，主力尽丧，妻子阿奴也战死沙场。
而策妄阿拉布坦再次抄掠其后方营地，使噶尔丹彻底失去翻身之本。
1697年，清军继续扫荡残余势力。
噶尔丹身边只剩数百人，最终死于科布多附近。
其遗体被火化后，部下携骨灰欲降清，却被策妄阿拉布坦拦截收编。
1698年，策妄为向清廷示好，将噶尔丹的骨灰送至北京。
至此，噶尔丹纵横一时的事业以彻底失败告终。
他的结局，既源于战略失误，也因家族内斗而起，最终在清军和侄子的双重打击下走向灭亡。
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