1950年3月，“吴石案”引发国民党军方高层人事调整后参谋本部新任总长、副总长、次长与陆、海军及联勤总司令的合影。吴石（国防部参谋次长）因中共地下党身份暴露后，周至柔以参谋总长身份亲自下令搜查吴石住所、办公室，获取关键证据，并签报蒋介石组织高等军法会审。最初，审判长蒋鼎文等人拟判吴石重刑但免死。呈报后，蒋介石大怒，批示“审判不公”。周至柔遵照蒋的意旨，推翻原判，最终促成吴石、朱枫等四人被判处死刑，并于1950年6月10日执行枪决。