1949年10月1日新中国成立后，邓宝珊被任命为甘肃省政府主席。得知这个任命后，邓宝珊给毛主席写信，请求不去甘肃，而是先学习一段时间。毛主席看了来信后，把邓宝珊请到中南海。 邓宝珊十五岁就投身军旅，早年参加伊犁起义，后来在陕西等地带兵。1924年底他在陕县办军官传习所，聘请共产党员担任所长和秘书长。1926年顺泸起义失败后，刘伯承在西安处境困难，他派人送去六百银元和通行证，帮助刘伯承安全转移。 抗战时期他驻守榆林，和陕甘宁边区保持稳定联系，没有制造摩擦，毛主席还专门写信感谢他。1938年和1939年他两次路过延安，停留参观了抗大和陕北公学等地方，和毛主席有过交流。 解放战争后期，他作为傅作义的全权代表，参与北平和平解放的谈判，经过三天商谈达成协议，后来又促成绥远起义和宁夏马鸿宾部起义，减少了战事损失。这些实实在在的贡献，让中央对他特别信任，所以新中国成立后任命他回甘肃主持政务。 任命通知下来后，邓宝珊没有马上准备出发。他多年带兵，对地方行政管理缺少系统经验，加上甘肃刚解放，战后局面复杂，他觉得直接上任可能不合适，就写信给毛主席说明情况，请求暂缓赴任，先到基层学习一段时间政策和实际工作。 信里态度很诚恳，没有推脱的意思，只是想把事情办得更稳妥。毛主席收到信后，没有任何责备，反而安排邓宝珊到中南海当面谈。见面时毛主席听取了他的顾虑，主要是担心过去在战场上和彭德怀有过交手，今后在西北工作配合起来可能有不便。 毛主席明确表示彭德怀是好同志，工作认真负责，为了今后合作顺利，建议邓宝珊先起草一份电报，由自己代为发出，向彭德怀说明情况。 邓宝珊同意了，当场草拟内容，毛主席稍作修改后安排发出。没过多久，邓宝珊就接到彭德怀的电话，表示欢迎他到甘肃工作。这次中南海的交流打消了顾虑，他很快接受任命，准备赴任。 1950年1月8日甘肃省人民政府在兰州成立，邓宝珊正式就任主席。当时兰州解放不久，基础设施破坏严重，他没有坐在办公室听汇报，而是多次到各地实地查看情况。 去会宁等干旱地区考察时，汽车走不了，他就和随行人员一起推车或步行前进，一边走一边和当地群众交谈，了解生产生活中的实际困难。通过这些调查，他掌握了甘肃的真实情况。 1950年全国政协会议上，他提交了筹建民族学院和统一薪资标准的提案，中央很快采纳，推动西北民族学院开始建设。他主政甘肃期间，一直注重深入基层，关注民生问题，没有搞形式主义。 1960年自然灾害期间，甘肃百姓面临粮食短缺，他到基层收集情况，把榆树皮粉和油渣混合做成饼子，通过渠道送到北京给毛主席，实事求是反映问题。 建国初期全国民主人士出任省政府主席的只有湖南程潜和甘肃邓宝珊，一时有“南程北邓”的说法。他担任甘肃省政府主席，后来又当选省长，连续工作了十七年，直到1966年。 邓宝珊对甘肃的干旱和民生问题特别上心，多次推动水利和农业方面的实际措施。他不搞空谈，总是通过实地考察来决定政策方向。这些年甘肃在恢复生产和民族团结方面取得进展，和他的努力分不开。