九、若能转物即同如来，有两层意思。一方面意思是只有如来才能彻底转物而不被物转。因为如来修到佛地，断尽一切无明，所有功德圆满具足，能一念之间变现无量无边之多的五蕴色身，也能一念间变现无数三千大千世界，所有物质色法都随如来而转变。所以能究竟转物的人与佛齐，就是如来。
另一方面意思是只有如来藏才能转变物质色法，不被物质色法而转。因为如来藏是三能变识中最强大的一个，含藏一切物质色法的种子，能随意根之意输出四大种子，而变现转变一切物质色法，七识妄心没有种子，不能出生和转变物质色法，但能调动如来藏变现和转变物质色法。所以如来藏是一切物质色法的主人，一切物质色法归如来藏所有。
十、既然一切法都由如来藏所出生，为什么还说三能变识共同变现万法？世间一切万法虽然是由如来藏变现出来的，但是单独一个如来藏不根据外缘无法变生一切法，如来藏必须依赖相应的缘才能产生一切法，孤因不生法。
唯识讲三能变识，如来藏是第一能变识，意根是第二能变识，前六识是第三能变识。如来藏与第七识和合变生根身器界，再与六识和合，才能产生一切法。如果前六识不参与变现，很多法就不能现行出来。六识所有的运行活动都作为种子存入如来藏里，如来藏依据这些种子，才能产生万法，没有这些业种，如来藏也就不能生万法了。
就像四果罗汉，他们六识的身口意行已经清静了，不愿意多造作世间有为法，三界世间的种子就不再集聚了，意根也就不执三界世间法，那么他们临终就会入无余涅槃，然后只剩下如来藏，不产生任何法。因此三界世间法的出生，一定是三个能变识共同和合产生出来的，单独如来藏不生法，不变法。我们现在的六识如果都无为了，不愿意造作身口意行，也就不会产生种子，未来世就不再出生五阴，生死链条就断。三界世间法的出现，一定是八个识共同运作的结果。
十一、唯识里讲三个能变识，第一能变识是如来藏，祂具有不生不灭性，是出生众生五蕴、六根、六尘和六识，出生万法的直接根源。
第二能变识是意根，祂是时时处处做主宰的识心，身口意行的一切造作都由祂来决定，而祂总是依赖着如来藏而向外攀缘一切法，祂攀缘什么法，如来藏就随顺着变现什么法，所以意根也能间接的使得如来藏出生一切法。
第三能变识是六识，以意识为主，意识是最主要的分别识，多数时候与前五识一起分别，有时自己也单独分别，内心里知道了就是分别完成了，六识能配合意根和如来藏共同显现出六尘境界，六识也能影响意根的抉择，意根有时要依赖六识的了别，而攀缘六尘万法，然后作主决定造作身口意行，如来藏就要配合意根出生万法。因此如来藏、意根和六识三者和合运作，就能变生万法，这就是出生万法的三能变识。
十二、前六识如果想了别六尘，多数时候是受意根支配和指挥的，由于意根的攀缘作意，如来藏就要随顺着出生六识，出生六识以后，六识就想要了别六尘，于是就触六尘，触之后就起了别作用，业行就造作出来了。意根总是攀缘作意三界世间法，寻求三界世间法，但能不能攀缘和寻求得到，也在于业缘是否成熟，如来藏里是否有业种。如果有业种，而且业缘也成熟了，如来藏才能随顺配合着出生意根所作意的法；如果没有业种，或者业缘还不成熟，那么如来藏就配合不了，不能满足意根所愿，现起祂所攀缘的法。
如来藏只是按照因缘，按照业种，变现出万法，让六识来分别和取舍，但是如来藏要为六识输送识种子，六识才能现行出来起用。所有一切法都是如来藏随顺因缘和业种而变现出来的，意根的攀缘和作意在因缘条件允许的情况下，如来藏都会随顺，没有选择，没有条件，也不求回报。而意根的作意和攀缘，也在于六识的了别情况如何，有时意根也要根据六识的了别，来作取舍，作抉择，如来藏再依据意根的作意出生相应的法。
如来藏出生万法，不是七识控制的，而是如来藏本身的柔顺性、随顺性、不作主性决定的，这是如来藏的运行规律之一。证悟后可以通过各种方法观察如来藏的随顺性，看看祂是否很柔顺，是否完全配合；观察后发现果然是如此，不管你做什么，祂全部都是随顺配合，一点也不违拗七个识，当然有很多事情还是实现不了的，因缘不具足，如来藏也就没办法实现意根的愿望。所以有人说：如来藏是贴体的衣服，随身又适意。
十三、如来藏究竟是如何改变物质色法的四大结构，又依据什么来改变的呢？如来藏改变四大元素的结构、比例成分，是依据众生的业种和业缘。因为如来藏要刹那刹那输出四大种子，祂要改变四大结构，只要每一刹那输出的四大种子的成分稍微有所不同，多少个刹那之后，物质就会发生变化，非常快，有的物质改变就要慢一些，这也决定于业种和业缘。
比如这一刹那输出的四大元素的比例为，地：水：火：风=40:30:20:10，那么下一个刹那就可以改变为：41:30:19:10，再下一个刹那可能就改变为：42:30:18:10，再下一个刹那，还会一点点的改变，四大种子的排序状态也要发生变化，那么到一定时候，物质就有明显的变化了。物质世界的成住坏空，就是这个原理，众生色身的变化也是这个原理。
而器世间里的一切物质色法，它们的改变就要慢一些，甚至要极慢，这一方面是因为器世间里的物质太庞大了，改变的不可能明显，众生觉察不出来；另一方面也涉及到了所有众生的业种，需要所有众生的如来藏共同密切配合，才能完成，所以宇宙器世间的改变要非常的缓慢。比如家里的桌椅板凳，书籍纸张，是在一点点地发生改变，就是如来藏的功能作用。我们的衣服，一天天地变旧，一天天地磨损，并不是衣服本身就能有这样的作用，都是如来藏依我们的业缘，把衣服变旧，最后毁坏，不存在了。没有如来藏心之外的物质作用，心外无法，就是这个道理。
一弹指间，有81000个刹那，这其中要有多少个种子生灭变异过去了，物质的最初变化，我们实在没法察觉，只有变化集聚到一定程度，我们才能了知到。所以三界世间里所有物质的生、住、异、灭，没有一样能离开如来藏，而能有其单独作用的，都是如来藏所为所执持，在其中所起的作用，所以三千大千世界也叫作一真法界。
十四、唯心所现，唯识所变，这里的心和识有什么异同？心指第八识如来藏，识指八个识。一切法产生的根本来源、直接来源是如来藏，叫作三界唯心。而我们所接触的一切法的现起，需要一定的助缘，如来藏才能出生万法，单独一个如来藏不能出生一切法。因此万法是如来藏第七识前六识三者和合变现出来的。第一能变识是如来藏，第二能变识是第七识，第三能变识是前六识，这叫作万法唯识。
十五、众生之间的互动关系是如何实现的现在的互联网电脑能在自己的电脑上控制别人的电脑，通过在自己的电脑上操纵别人的电脑程序，帮助别人把电脑修好了，再者我们通过互联网可以在自己的电脑上访问别人的网站。通过观想治病的道理也如远程控制修理电脑一样，如来藏之间也是互遍互摄互知的，否则因果就无法实现，众生之间就不能互动了。比如一个人病了，有个修行人就在自己的住处通过观想这个人的病变部位恢复健康，然后这个人病就好了。
色身是各自的如来藏执持着的，但通过观想，他人能把他的色身改变了；改变色身的是自己的如来藏，不是别人的如来藏。但是自己的如来藏能与他人的如来藏互通，能受到他人如来藏的影响。如来藏可以随顺自己的意根，意根又能受到意识的思惟观想的影响；而如来藏之间互相又能沟通和影响，那么众生之间就能互相沟通、互相影响，就能互动，就像互联网电脑之间的关系一样。
因此，一个众生就能利益和损害另一个众生，改变另一个众生的色身。甲的一切事情，都是甲的如来藏作用的，但是乙影响了甲，甲的如来藏就受乙的影响了，实际上是如来藏之间的影响力。医生给病人治病，也是这个道理，心想事成，也是这个道理，成事坏事都靠如来藏，由三个能变识共同变现而成就。