中东战争之所以绵延不绝、难以平息，根本原因在于多重根源性矛盾、外部霸权干预、地缘战略竞争以及深层社会经济问题相互交织，构成了一个复杂的“冲突综合体”。
历史结构性矛盾，主要体现为殖民遗产和边界争端。一战后，英法对奥斯曼帝国进行“分治”，人为划分边界、构建现代民族国家体系，制造族群对立，加剧了中东地区的内部分裂。核心的巴勒斯坦领土争端包括：1947年联合国分治决议有失公平、1948年以色列建国引发“大浩劫”、1967年六日战争后以色列对约旦河西岸等土地的占领、持续扩建定居点以及耶路撒冷最终地位问题。
外部霸权与强权政治方面，美国深度介入是关键因素。美国以地缘政治（防止地区出现挑战其霸权的强大国家）和石油利益（掌控石油定价与结算权，维系“石油美元”霸权）为目标，历史上推翻伊朗民选政府、发动战争，直接导致当前诸多矛盾。美国作为唯一的超级军事存在，常将冲突作为转嫁矛盾的工具，且偏袒以色列，使政治解决之路遥遥无期。
地区霸权与安全困境的核心是“安全困境”。各国为求自保增强军力，却被邻国视为威胁，从而引发军备竞赛和冲突。激烈的霸权争夺还催生了“代理人战争”频发的对立阵营，如伊朗和沙特（现已复交）围绕也门和叙利亚等地展开较量。
文明与民族的对峙体现在宗教认知差异（伊斯兰世界与西方及以色列的对立）和身份认同之战（阿拉伯、波斯、犹太、库尔德等多民族诉求的激烈冲突）两方面。
深层经济与社会问题上，高失业率、贫富差距大以及资源匮乏为极端主义滋生提供了土壤。此外，战争破坏了本就脆弱的经济，形成恶性循环。