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中科曙光出手,生物医学等来神助攻! 生命科学领域的算力需求有多狠?做过基因比对的

中科曙光出手,生物医学等来神助攻!
生命科学领域的算力需求有多狠?做过基因比对的人知道,一个全基因组测序数据跑几天几夜是常事。蛋白质折叠模拟更是无底洞。
中科曙光发布会直播里讲到生命科学场景时,提到了两个关键技术:AVX-512指令集支持和4线程技术(SMT4),说与生信领域高通量计算“完美匹配”。
拆开来看。AVX-512对分子动力学模拟的加速效果是公认的,GROMACS、NAMD这些主流软件的核心求解器全绑在这个指令集上。现场特意强调是“原生支持”,不需要重新编译就能调用最高性能路径。以前国产平台跑这些软件天生瘸腿,现在这个短板被补齐了。
4线程技术也很有针对性。生信领域很多任务是高吞吐量的小任务并行,SMT4能让一个物理核心同时处理4个线程,任务并发能力翻倍,调度开销降低。两个加在一起,高通量计算场景就被覆盖得很完整了。
发布会上还展示了风冷、冷板、浸没三种形态。像基因测序中心那种几百个节点的集群,用冷板式液冷把PUE压到1.08,电费能省一大截。对于高校生信实验室来说,这个吸引力不小。生命科学信创替代喊了很多年,一直卡在跑不动。这次可能真能往前推一步。
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