琼崖纵队的主要作用是作为内应接应。
1、琼崖纵队派人送信，决定了采用分批小规模偷渡＋强渡相结合的作战方针，这是最顶级；
2、前几次小规模偷渡的部队登陆后遇敌苦战时，都是琼崖纵队不计生死的在敌之背后发起攻击，敌腹背受敌迅速崩溃，偷渡部队从而迅速摆脱敌人；
3、在40军、43军大规模强渡前夕，琼崖纵队在中部发动大规模行动，把敌主力调动至那大等中部地区并牢牢牵制住，使敌之海口沿海地区防守兵力不足。
因此，琼崖纵队人数虽然不多，装备奇差，然而琼崖纵队通过内应接应，牵制和阻击，是海南战役不可或缺的作用。