孙一奎（1522‑1619），字文垣，号东宿，又号生生子，明代新安医家，温补学派代表人物，安徽休宁人。年少习儒，后转而学医，遍访各地名师，博览医籍，临证经验丰厚。
孙氏贯通诸家，不偏执一家之言，核心学术贡献为命门动气学说。他提出命门并非有形脏腑，而是人身原气发动的枢机，维系一身气血运行。既推崇朱丹溪，又纠其寒凉之偏，重视三焦相火，擅长调补元气，反对滥用苦寒攻伐。临床各科皆有造诣，尤其善于诊治虚劳、杂病。
著有《赤水玄珠》《医旨绪余》《孙氏医案》。《赤水玄珠》汇集内科杂病论治，分类详实；《医旨绪余》阐发医理，辨析命门、三焦等重大理论问题；医案记录真实诊疗过程，理法方药完整。
孙一奎完善了明代温补学派理论体系，对后世命门学说发展启发很大，其固本调元的思路，至今仍具备临床借鉴意义。