慈禧生前享受了太多的荣华富贵，然而在她死后却是相当的凄惨。1928年，大军阀孙殿英以军事演习为名，用炸药炸开慈禧陵墓定东陵的地宫，进行了长达七天七夜的疯狂盗掘 。盗墓案件发生以后，慈禧墓及慈禧遗体的惨状令人触目惊心，地宫内原本价值连城的奇珍异宝被洗劫一空，连棺椁上的金漆都被士兵刮走 。慈禧的棺椁被强行劈开，破碎的外椁被随意丢弃在地宫角落，现场一片狼藉 。慈禧的遗体被士兵从棺内粗暴地拖出，扔在地宫冰冷的地上 。她原本穿着的华丽礼服也被扯破，上衣被扒光，下体仅剩一条内裤，左脚还挂着袜子，右脚赤裸 。由于士兵急于寻找宝物，她的身体遭到严重的破坏，脸颊被人用刀捅出了一道大口子，嘴巴被豁开，牙齿也被硬生生抠掉。
在被盗墓贼发现时，慈禧的遗体已经出现了腐烂的迹象。尸体被遗弃在墙角，身上长出了寸许长的白毛，并出现了拳头大小的尸斑，地宫内散发着恶臭。
盗墓事件败露后，清逊帝溥仪派载泽等人前往东陵进行善后和重新入殓。当他们进入地宫时，发现慈禧的尸体头朝北、脚朝南趴在地上，左胳膊被拎起背在肩上，右手向前伸出，姿态极其凄惨。众人只能用一块黄绸子将遗体盖上，将其翻转仰卧后重新放入棺内，并用黄缎袍和坎肩遮盖，最后封棺重殓 。
到了1984年，文物专家再次打开慈禧内棺进行检查时，发现其遗体并未完全腐烂，而是变成了一具干尸，且脸颊上被刀扎出的伤口依然清晰可见 。工作人员小心翼翼的将慈禧遗体抬出，并向棺内喷洒了防腐消毒液，随后将遗体按原样放回，并重新用漆封好了棺口。此后，这具棺椁再也没有被打开过 。
目前，慈禧太后的遗体依然静静地躺在位于河北唐山遵化市的清东陵地宫棺床上，头朝北、脚朝南。由于地宫内常年保持恒温，加上1984年的防腐处理，这具干尸至今保存仍较为完整。如今，清东陵已作为国家AAAAA级旅游景区对外开放，慈禧的陵寝也被作为历史遗迹供后人参观。