1952年，王震在新疆工作多年后被中央当面严厉批评，一场职务调整让他离开了自己亲手建设多年的新疆。多年以后，他仍然说，这段经历是自己一生中受到的最大打击之一。
1949年，王震率领第一兵团进军新疆，促成新疆和平解放。进疆以后，他带领部队投入生产建设，开荒造田，兴修水利，兴办工厂，同时组织剿匪和维护社会秩序。十万大军从战场转向生产建设，在当时的新疆大地上开始了艰苦的屯垦事业。
但真正让王震遭遇转折的，并不是战场上的失利，而是一次改革工作的节奏问题。
当时中央对新疆的民主改革采取“慎重稳进”的方针。农业区可以先开展减租和土地改革，牧区情况则比较复杂，需要暂缓一步，等条件成熟后再逐步推进。因为新疆不仅涉及当地社会稳定，还牵动西藏、内蒙古以及甘肃、宁夏等地的牧区工作。
王震看到一些牧区群众生活困苦，对牧主制度中的压迫现象十分不满，希望尽快推动改革。1952年，新疆分局开始草拟伊犁牧区改革方案。在中央统一部署尚未明确调整之前，新疆方面已经提前着手安排相关工作。
这件事很快引起中央重视。
1952年5月，中央决定纠正新疆分局在牧区改革上的冒进做法。同年6月，王震到北京开会，毛泽东专门找他谈话，直接指出他“只看到新疆，没看到全局”，强调少数民族地区的改革必须按照中央统一部署推进。
毛泽东同时对王震的功过作了明确评价：他的成绩是主要的，错误是次要的，但这个错误是严重的。
这句话对王震的冲击很大。
因为在王震看来，自己进疆以来一直在拼命干。他带部队打下新疆，又让军队放下枪杆子拿起农具，在荒漠戈壁上开荒、修渠、办厂。如今因为牧区改革的问题受到严厉批评，对他来说并不容易接受。
随后，新疆召开第二次党代会，对牧区改革冒进以及经济建设中存在的急躁问题进行批评。中央也随之调整新疆分局领导班子，王震不再担任中共中央新疆分局第一书记、新疆军区政委和财经委主任等职务，但并不是所有军队职务都被撤销。
这次调整，也意味着王震结束了在新疆最重要的一段政治和军事生涯。
1952年12月，王震在兰州参加会议期间突发重病。1953年3月，他离开新疆前往北京治病。那个曾经带着部队进入新疆，又在戈壁滩上带人开荒建厂的将领，就这样离开了自己奋斗多年的地方。
后来回忆起这段经历，王震曾说，新疆这段经历是对他一生最大的打击。
但这件事并没有让他彻底放下新疆。
1979年，时任新疆维吾尔自治区党委书记汪锋曾向中央提交报告，认为当年对王震的部分批评与实际情况并不完全相符，对相关职务调整也提出了重新评价的意见。
而王震自己，在离开新疆多年之后，仍然念念不忘这片土地。
晚年，他先后多次重返新疆考察，并积极推动恢复新疆生产建设兵团。50年代，他曾经带着部队在新疆从零开始搞生产建设；几十年后，他又重新参与推动兵团事业的发展。
对他来说，那里既有一段功勋卓著的岁月，也有一次终生难以释怀的挫折。直到晚年，他仍然把大量心思放在新疆的建设上。