1941年，中共中央华中局决定成立淮北苏皖边区行政公署、淮北区党委、淮北苏皖边区军区，并成立军政党委员会统一领导党政军工作。
1941年2月，张爱萍率新四军第三师第九旅西返皖东北，经过40余天连续作战，恢复了皖东北根据地的基本区；5月肃清洪泽湖土匪武装，使洪泽湖成为根据地内湖。
至1941年，皖东北抗日根据地全部恢复，专署下辖六个县办事处和洪泽湖管理局及两个直属区署，共有120多个乡政权。图为1941年，陈毅与淮北区党委成员的合影，左起：刘子久、邓子恢、陈毅、彭雪枫、刘瑞龙、吴芝圃