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破局传统药研困境!藤核智能助力河北医科大学搭建智能药物平台,构建药研‘超级工具库’

传统药物研发,是一条充满挑战的 “漫长征途”—— 一款新药从最初的发现到最终成功上市,平均需要耗费 10-15 年时间,

传统药物研发,是一条充满挑战的 “漫长征途”—— 一款新药从最初的发现到最终成功上市,平均需要耗费 10-15 年时间,投入数十亿美元资金,即便如此,成功率依然低得惊人。这样 “周期长、成本高、成功率低” 的瓶颈,让攻克癌症、神经退行性疾病等复杂病症的进程屡屡受阻,也成为制约医药行业创新发展的关键难题。

如今,随着人工智能(AI)、大数据与生物信息学的深度融合,智能药物研发应运而生,为打破这一困境带来了革命性契机。上海藤核智能科技有限公司(以下简称“藤核智能”)作为深耕智能医学的技术先行者,积极参与河北医科大学医学科研数据中心智能药物平台的搭建,以技术赋能推动药物研发迈入数据驱动、智能计算的全新时代,为医药行业创新发展注入强劲动力。

硬核平台:全流程覆盖,打造智能药研“利器库”

河北医科大学医学科研数据中心智能药物平台,整合国际顶尖工具与自主技术,实现从药物早期发现到后期优化的全流程数字化管理,为创新药物研发提供高效、精准的一体化解决方案,而上海藤核智能在平台的工具集成、技术适配等方面提供了重要支撑。

01国际顶尖商业软件:构筑核心研发能力

平台以 Schrödinger、MOE 两款国际知名商业软件为核心,凭借其强大功能与专业性能,为药物研发筑牢基础,满足不同场景下的研发需求:

Schrödinger:功能全面的 “全能选手”

作为功能完善、信息全面且计算方法获专业公认的软件,Schrödinger 不仅易用性出众,还能完美适配教学与科研双重需求,核心功能涵盖:

·分子对接:支持基于受体和配体结构的诱导契合、柔性对接,以及基于受体结构的对接模式,精准预测分子结合情况;

·药物设计:可进行组合化学库设计及基于组合库的对接,开展基于配体结构的药效团、3D-QSAR 研究,实现靶点导向的药物设计;

·模型构建:能按照最佳实践自动创建和应用预测性 QSAR 模型,助力化合物活性预测;

·生物模拟与属性预测:可模拟蛋白、糖、核酸、小肽等生物分子结构,还能预测药物 ADME 性质,同时支持抗体药物设计。

MOE:覆盖全品类的 “多面手”

由加拿大 CCG 公司开发的 MOE,是功能强大的综合药物设计平台,从小分子药物到大分子药物设计均能胜任,九大核心模块几乎涵盖当前药物设计的主要功能与方法,亮点十足:

·小分子药物设计:拥有药效团发现、分子对接(含蛋白 - 配体共价对接、多蛋白批量对接)、结构 - 活性分析、QSAR、骨架置换等成熟功能,其药效团的 EHT 注释方式可定量相互作用强度,交互式 3D 可视化界面能让药物化学家在蛋白空腔中轻松改造化合物,并实时获取化合物属性及与蛋白的亲和力信息;

·生物药设计:支持蛋白模建、抗体同源模建、抗体亲和力成熟突变模拟、融合抗体设计、ADC 设计、酶改造优化,还能预测蛋白理化性质、优化蛋白沉聚性质、预测蛋白 - 蛋白相互作用、开展抗体人源化设计;

·广泛适用性:可应用于小分子、大分子、核酸、多糖、多肽设计,深受生物学家、结构生物学家、计算化学家、药物化学家等各类使用者青睐。

02开源工具集:拓展研发边界,降低科研成本

除商业软件外,平台还深度融合20余款国际主流智能药学开源软件,搭建起强大的科研工具集,进一步增强多学科研究支撑效能,其中多款工具在行业内极具影响力:

·蛋白质结构预测领域:AlphaFold3 在该领域取得显著突破;ColabFold 使用 MMseqs2 替代 MSA,能快速生成多种序列比对并精准预测含复合体的蛋白结构;ESMFold 可预测细菌、病毒等微生物中 6.17 亿种蛋白质结构;

·分子模拟与设计领域:RFdiffusion 是深度学习驱动的蛋白质设计工具;Amber、Gromacs、Lammps 为分子动力学模拟提供有力支持;

·药物筛选与对接领域:AutoDock 是基于结构药物发现的方法集;AutoDock Vina 快速精准,可预测小分子与生物大分子的结合模式、亲和力及三维结构;

·可视化与计算领域:PyMOL、VMD 是功能强大的分子可视化软件;Cp2k 、Quantum Expresso 可开展原子模拟与电子结构计算;Rosetta、RoseTTAFold 系列则在高分子建模、复杂生物分子组装体结构建模中发挥重要作用。

价值彰显:多维度赋能,推动医药创新发展河北医科大学医学科研数据中心智能药物平台的建成,在上海藤核智能的技术助力下,将从多个维度为医药行业发展注入新活力,实现科研与产业的协同共进:

·提升科研成果质与量:平台通过高效的数据分析、精准的模型预测,帮助科研人员减少试错成本、提高研究效率,推动科研成果在数量和质量上同步提升;

·加速产业转化效能:全流程数字化管理打通药物研发各环节壁垒,促进科研成果与产业需求精准对接,加快创新药物从实验室走向市场的步伐;

·深化跨机构科研合作:平台将成为连接国内多所高校、企业、医疗机构的桥梁,推动多学科交叉融合,汇聚各方智慧攻克医药研发难题;

·增强学科与人才实力:为河北医科大学国家级和省级一流特色医药学科建设提供支撑,吸引和汇聚高层次医药研发人才,为行业发展储备智力资源;

·服务国家战略需求:聚焦重大疾病新药创制,加速针对癌症、神经退行性疾病等复杂病症的药物研发,助力实现个性化精准医疗,守护人民健康。

携手同行:诚邀合作伙伴,共筑医药新未来

医药事业的发展离不开各方力量的协同合作。河北医科大学医学科研数据中心与上海藤核智能科技有限公司,诚挚欢迎国内外高校、医药企业、医疗机构携手共进,围绕智能药物研发技术创新、科研项目合作、人才联合培养等方面开展深度合作,共同攻克医药研发难题,推动医药事业高质量发展,为守护人类健康贡献力量!